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2021年度 バイオDXプログラミング演習Ⅱ (1031)

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科目区分 一般科目 教職科目 指定なし
単位数 1 選択・必修・自由 必修
授業形態 演習 主な使用言語 日本語
開講時期 履修登録システム 使用する
履修登録期間 2021/04/13~2021/05/14 履修取消期限 2021/06/25

教育プログラム別の履修区分

プログラム名 IS CB BS BN MS CP DS
履修区分
コア科目
履修方法 ・一般科目から4単位以上履修すること。

授業科目概要

担当責任教員 遠藤 求
担当教員 加藤博一、加藤壮英
教育目的/学修到達目標 【教育目的】
バイオサイエンス領域の研究に携わる上で得られる実測データ、画像データ、さらに公共データベースにある情報などを利用し、プログラム言語(Python)を用いてデータ解析できるための実践を目指した演習を行う。

【学修到達目標】
1) Pythonを用いたデータ解析に必要な基礎知識を習得する。
2) Pythonを用いたデータ整理、議論ができる。
3) Pythonを用いて簡単なプログラム作成できる。
授業概要/指導方針 【授業概要/指導方針】
昨今のバイオサイエンス領域の研究では、高度な機器を利用した配列解析、発現解析、更に画像解析の必要性が高まっており、日々の研究のなかで様々な性質の、場合によっては大量のデータに接する事となります。また、公共データベースより、大量のゲノム情報、遺伝子発現情報を取得することもできます。各研究者がそれぞれのアイデアに基づいて、取得したデータを加工・分析し、わかりやすく表現する力がますます必要となっています。
ここでは、Python等のプログラム言語を用いてバイオ研究に必須となるデータの取得や、データの表現、また、顕微鏡から得られる画像データの扱い方について紹介し、演習を行います。将来、直面する実践的応用的な利用の足掛かりとなるようなプログラミングの知識をつけます。

クラス情報



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授業計画

[1限目 9:20-10:50] [2限目 11:00-12:30] [3限目 13:30-15:00] [4限目 15:10-16:40] [5限目 16:50-18:20] [6限目 18:30-20:00]
回数 日付 [時間] 担当教員 テーマ 内容
1 6/23 [5] 加藤 壮英
2 6/25 [5] 加藤 壮英
3 6/28 [5] 加藤 壮英
4 6/30 [5] 加藤 壮英
5 7/1 [5] 加藤 博一
6 7/2 [5] 加藤 博一
7 7/12 [5] 加藤 博一
8 7/13 [5] 加藤 博一

授業日程

[1限目 9:20-10:50] [2限目 11:00-12:30] [3限目 13:30-15:00] [4限目 15:10-16:40] [5限目 16:50-18:20] [6限目 18:30-20:00]
回数 日付 時間 講義室 備考
1 6/23 5 Rethink バイオサイエンス大講義室〔L11〕
2 6/25 5 エーアイ大講義室[L1](IS) エーアイ大講義室[L1]が使用不可の場合、Rethinkバイオ大講義室[L11]を使用
3 6/28 5 エーアイ大講義室[L1](IS) エーアイ大講義室[L1]が使用不可の場合、Rethinkバイオ大講義室[L11]を使用
4 6/30 5 エーアイ大講義室[L1](IS) エーアイ大講義室[L1]が使用不可の場合、Rethinkバイオ大講義室[L11]を使用
5 7/1 5 エーアイ大講義室[L1](IS) エーアイ大講義室[L1]が使用不可の場合、Rethinkバイオ大講義室[L11]を使用
6 7/2 5 Rethink バイオサイエンス大講義室〔L11〕
7 7/12 5 エーアイ大講義室[L1](IS) エーアイ大講義室[L1]が使用不可の場合、Rethinkバイオ大講義室[L11]を使用
8 7/13 5 エーアイ大講義室[L1](IS) エーアイ大講義室[L1]が使用不可の場合、Rethinkバイオ大講義室[L11]を使用

テキスト・参考書

テキスト 特に指定しない
参考書

その他

履修条件 バイオDXプログラミング演習Iを履修済みあるいは、一定程度のPythonでのプログラミング経験を有すること。
オフィスアワー Eメールで連絡の上、日時を決める
成績評価の方法と基準 ・5段階で評価する(秀・優・良・可・不可)で評価する。
・評価は、毎回の授業で取り組む課題の達成度で評価する。
・バイオサイエンスで得られる様々なデータに対して、プログラム言語(Python)を用いた処理方法の習得、理解を成績基準とする。
関連科目 バイオDXプログラミング演習I、バイオDXデータ処理演習I、バイオDXデータ処理演習II
関連学位 バイオサイエンス
注意事項 特になし

授業関連URL



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配布資料



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